Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ndufb8Q9D6J5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ndufb8Q9D6J5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms