Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmtm5Q9D6G9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Cmtm5Q9D6G9 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmtm5Q9D6G9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms