Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Krt34Q9D646 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Krt34Q9D646 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Krt34Q9D646 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms