Protein–RNA interactions for Protein: Q9D620

Rab11fip1, Rab11 family-interacting protein 1, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip1Q9D620 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rab11fip1Q9D620 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Rab11fip1Q9D620 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab11fip1Q9D620 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab11fip1Q9D620 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
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Rab11fip1Q9D620 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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