Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PudpQ9D5U5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PudpQ9D5U5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms