Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5J6

Shpk, Sedoheptulokinase, mousemouse

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShpkQ9D5J6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ShpkQ9D5J6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ShpkQ9D5J6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ShpkQ9D5J6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms