Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9D4W2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9D4W2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms