Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc83Q9D4V3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms