Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4931428L18RikQ9D4S9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4931428L18RikQ9D4S9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms