Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C1

Lmntd1, Lamin tail domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmntd1Q9D4C1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lmntd1Q9D4C1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Lmntd1Q9D4C1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Lmntd1Q9D4C1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms