Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Syce1Q9D495 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Syce1Q9D495 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms