Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
4933428M09RikQ9D3X3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
4933428M09RikQ9D3X3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms