Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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Krt20Q9D312 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Krt20Q9D312 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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Krt20Q9D312 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Krt20Q9D312 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Krt20Q9D312 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Krt20Q9D312 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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