Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700034E13RikQ9D2T6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700034E13RikQ9D2T6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
1700034E13RikQ9D2T6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
1700034E13RikQ9D2T6 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
1700034E13RikQ9D2T6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms