Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q2

Trmt44, Probable tRNA (uracil-O(2)-)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt44Q9D2Q2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Trmt44Q9D2Q2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Trmt44Q9D2Q2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trmt44Q9D2Q2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms