Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
4930583I09RikQ9D2E3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
4930583I09RikQ9D2E3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms