Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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Snapc3Q9D2C9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Snapc3Q9D2C9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
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Snapc3Q9D2C9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Snapc3Q9D2C9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Snapc3Q9D2C9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Snapc3Q9D2C9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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Snapc3Q9D2C9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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Snapc3Q9D2C9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snapc3Q9D2C9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Snapc3Q9D2C9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Snapc3Q9D2C9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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