Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trappc6bQ9D289 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc6bQ9D289 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc6bQ9D289 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms