Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Mrpl53Q9D1H8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Mrpl53Q9D1H8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Mrpl53Q9D1H8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms