Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Susd3Q9D176 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Susd3Q9D176 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Susd3Q9D176 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms