Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0T1

Snu13, NHP2-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snu13Q9D0T1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Snu13Q9D0T1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Snu13Q9D0T1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms