Protein–RNA interactions for Protein: Q9D083

Spc24, Kinetochore protein Spc24, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spc24Q9D083 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spc24Q9D083 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Spc24Q9D083 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms