Protein–RNA interactions for Protein: Q9D051

Pdhb, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdhbQ9D051 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PdhbQ9D051 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PdhbQ9D051 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PdhbQ9D051 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms