Protein–RNA interactions for Protein: Q9D032

Ssbp3, Single-stranded DNA-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp3Q9D032 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssbp3Q9D032 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssbp3Q9D032 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms