Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc47Q9D024 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc47Q9D024 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc47Q9D024 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms