Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Elp3Q9CZX0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Elp3Q9CZX0 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Elp3Q9CZX0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms