Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYC3

Tmem39a, Transmembrane protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39aQ9CYC3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem39aQ9CYC3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem39aQ9CYC3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms