Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snx7Q9CY18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snx7Q9CY18 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Snx7Q9CY18 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms