Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpusd4Q9CWX4 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Rpusd4Q9CWX4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rpusd4Q9CWX4 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms