Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tdrd12Q9CWU0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Tdrd12Q9CWU0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tdrd12Q9CWU0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.5 ms