Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Atxn3Q9CVD2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atxn3Q9CVD2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atxn3Q9CVD2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms