Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lhfpl3Q9CTN8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lhfpl3Q9CTN8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms