Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rhobtb3Q9CTN4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rhobtb3Q9CTN4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms