Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snw1Q9CSN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snw1Q9CSN1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Snw1Q9CSN1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms