Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Dis3Q9CSH3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Dis3Q9CSH3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Dis3Q9CSH3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms