Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CactinQ9CS00 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CactinQ9CS00 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CactinQ9CS00 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms