Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tm7sf3Q9CRG1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tm7sf3Q9CRG1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tm7sf3Q9CRG1 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms