Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR56

Nkiras2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras2Q9CR56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nkiras2Q9CR56 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Nkiras2Q9CR56 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkiras2Q9CR56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Nkiras2Q9CR56 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms