Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR50

Rchy1, RING finger and CHY zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rchy1Q9CR50 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rchy1Q9CR50 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rchy1Q9CR50 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms