Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg12Q9CQY1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg12Q9CQY1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms