Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ykt6Q9CQW1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ykt6Q9CQW1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ykt6Q9CQW1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms