Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PompQ9CQT5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms