Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atp5f1Q9CQQ7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp5f1Q9CQQ7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms