Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rab5aQ9CQD1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rab5aQ9CQD1 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms