Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chchd1Q9CQA6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Chchd1Q9CQA6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chchd1Q9CQA6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms