Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itgb3bpQ9CQ82 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Itgb3bpQ9CQ82 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms