Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Efcab2Q9CQ46 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Efcab2Q9CQ46 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Efcab2Q9CQ46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms