Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ40

Mrpl49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl49Q9CQ40 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl49Q9CQ40 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl49Q9CQ40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms