Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pole4Q9CQ36 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Pole4Q9CQ36 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms