Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Bcl11bQ99PV8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Bcl11bQ99PV8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Bcl11bQ99PV8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms